Markéta Hánová absolvovala obor japanologie na FF UK v Praze, kde získala také doktorát v oboru dějin umění. V Národní galerii Praha pracovala v letech 1998–2000 jako odborná lektorka, od roku 2000 jako kurátorka japonských sbírek a od roku 2012 působí ve funkci ředitelky Sbírky asijského umění.
Věnuje se dějinám a teorii japonské malby a grafiky, historii sběratelství a výstav japonského umění v Evropě (Japonské dřevořezy a jejich sběratelé v českých zemích, 2019), dialogu evropského a japonského umění včetně fenoménu japonismu (Japonismus v českém umění, 2014).